у большинства видов пол определяется довольно просто: у самцов есть припухлости в основании хвоста, а у самок их нет. хотя даже тут есть всякие ньюансы. например у ракодактилусов самки тоже имеют солидные припухлости, а самцы имеют еще более солидные, а у фельзум наоборот не так просто с первого взгляда понять кто самец, а кто самка по припухлостям. поэтому всегда лучше с чем-то сравнить.
можно определять пол зондированием - у самца зонд входит намного глубже, но у некоторых видов он входит глубоко и у самок.

также у очень многих ящериц есть бедренные или преанальные поры. у некоторых видов они есть только у самцов, у других у обоих полов, но у самок они мельче и из них ничего не выделяется.
вот несколько примеров.

полосатый геккон, взрослый самец:

взрослая самка:

у самки поры есть и их можно разглядеть. последний ряд крупных чешуек как раз с порами. но из них ничего не выделяется.

то же самое у фельзум:

самец:

самка:

а вот у бананоедов сложнее. у самки пор нет вообще, у самца они есть, но очень незаметные. нужно долго приглядываться, чтобы их увидеть.
вот самка:

а вот самец:

у них поры находятся не на бедрах, а где-то посередине между ними. вот лучше не смогла их сфотать:

впринципе у бананоедов можно определить пол и без пор - у самца значительно крупнее припухлости. но это только у взрослых, а вот у молодых они примерно одинаковые.  у малышей от 4-х месяцев можно примерно определить пол, разглядывая их под лупой. у самца немного другая структура чешуек. то же самое у полосатых гекконов - поры укрупняются намного раньше, чем появляются значительные припухлости.